日本东京都5月4日上午6：00。
“砰——”
一声枪响打破了早晨的宁静。
“怎么了？”
“发生什么事了？”
……
议论纷纷的人们寻声而来，起初只是以为是孩子在玩鞭炮的声音，想过来教训一下那孩子，可当他们看到倒在血泊中的人后，女人们立即尖叫起来。
“谁谁去叫救护车啊！”人群中最有理智的人喊道。
接着一个人测了测中弹者的脉搏，摇了摇头，说：“不用叫了，他，已经断气了。现在应该联系警方。”
再看中弹者，不过是一副高中生模样，低着头，让人看不清他的脸却令人十分心疼，不过是一个学生，竟然就这么过世了。
之后，警视厅搜查一科的目暮警部来了，他一眼就认出了，这名被害人的脸，是当今的高中生侦探，平成年代的福尔摩斯，日本公安的救世主——工藤新一。
“工……工藤？”高木警官看到这张脸，很是惊讶。
“不会吧！？”佐藤警官同样的。
“工藤同学？怎么会…”目暮警部那难以置信的表情，他只希望，这不是真的；只希望，这个人只是和新一长得很像而已。
虽然封锁了现场，但周围的人并没有退散，人群中有人惊喊：“那个人是工藤？那个有名的高中生侦探？”
再后，周围围观的人越来越多，都是听说“工藤新一在街边被人枪杀”这个事件而来的。
找到了凶器，8mm的子弹，是警用m3737，估计是从哪个警官哪里偷来的，因为这不可能是内部人员作案。
记者当然不会放过这么大好时机，已经联系好出版方今天日报的头条就是这个，而新闻记者也拍下了现场……
“不会吧！工藤他……”服部平次刚好看了日本的早间新闻，甚是震惊。
“工藤？被枪杀？警用37作案？组织干的！”灰原哀难以置信，前不久刚刚给工藤做好APTX4869的解药，没想组织这么快就找上了工藤。
“新一！？不要！！”只有她会这么激动吧，毕竟青梅竹马14年，也不只是青梅竹马的感情了。想想新一几天前说要回来，没想到真的回来了，却是这副模样，新一，再也不走了……吗？
她不敢相信，也不愿相信，前几天明明还说好，要一起去看电影，一起去逛街。一起过生日——工藤新一的18岁生日，就在今天。
明明都说好了，都准备好了，为什么？为什么？要毁约呢？
“果然我还是等不到你……”兰，毛利兰说，此时的她，眼泪流满脸颊，虽知哭是没有用的，可一想到，工藤新一已经死了，她最爱的人已经死了，眼泪流不自觉的落下来。
只不过她哭的压抑，这并不能缓解她心中的痛苦。
一想到今后不可能再听到那个大笨蛋推理狂的声音了，不会再听到他在那将福尔摩斯的事情了，不可能听到他那“兰，我回来了。”的话语了，整个人都虚脱了：“新一……”
她一个人来到现场，警方正准备将新一的遗体带回局里，兰百般劝阻了，看着那个心脏中弹的少年，是无尽的悲伤。她坐在他身旁，轻语：“新一，你回来了吗……再也不走了是吗……”
“小兰，节哀吧！工藤同学他……”目暮警部安慰着她。
平次来了，小哀来了，阿笠博士来了，工藤服部来了，少年侦探团来了，毛利夫妇来了……任何有关系的人，都来了。
新一的身份真相大白了，令所有人都极为震惊，昔日的那个叫江户川柯南的男孩，正是他。
“小兰，工藤的手机里，存有给你的信，你看看吧！”高木警官将那只红色的手机递给兰，那是一封没有发出去的邮件。
兰：
对不起，隐瞒了一年至现在——我就是江户川柯南的身份。请你忘了我吧，好好活下去，我可不希望看到你伤心的泪水哟，所以，别哭了。对不起，让你等了那么久却一无所获，为此深感抱歉。找寻可以给你幸福的人吧，我会看着的哦。
新一
“笨蛋啊！白痴啊！这算什么！以为自己很了不起吗？这么大笨蛋推理狂！忘掉一个人哪有那么容易！”兰逞强着说，边擦干脸颊的泪水。
不顾周围的人和一切，向一个地方奔去，追寻他们的初遇，幼稚园樱花班，沿着以前的路向那个常去的公园走去，只可惜那公园早已重建成一栋办公大楼却依稀可见以前的幻觉……
“你叫什么名字？我可以帮你写上去！”
“工藤新一…樱花班！”
“好了，这个给你。新一同学，请你不要再叫我爱哭鬼了！”
……那个时候，仅仅4岁。
“新一，你还记得吧？我们的初遇。”又是兰的自语，“你说你弄丢了樱花名牌，看到我在用纸做，就那么臭屁，叫我帮你做……”
你让我等你，我履行了，可是你却远远的离开……
一个人走在街上，恍恍惚惚的，走过马路时是红灯却不知，就这样那般惨剧发生了……
可对于兰来说，却是一个最好的解脱：“新一，你不用一个人了，我去陪你了。”一语之后，永远的沉睡了。
……
几天后，工藤新一的葬礼，如期举行，只不过，下葬的人，多了一个——毛利兰，那是他们的葬礼，也是他们在冥界的婚礼，伴郎是服部平次，伴娘则是远山和叶。这是一个所有人都沉浸在悲伤之中的婚礼，伴郎伴娘替新婚夫妇饮下交杯酒，婚礼结束后，就开始了悲壮的葬礼。工藤新一，毛利……不，工藤兰，合葬。
“工藤，没有履行你的承诺，没有替你保护好小兰，非常抱歉。不过，既然你们两个都逝去了，也没什么好担心的了，祝你们幸福。”平次第一次落泪，生平的第一次就是在这个葬礼上，不但是因为他的对手兼挚友工藤新一，还为新一与兰有情人只能在冥界成眷属而感到惋惜。
……
十年后，平次与和叶走在街上，听到两个熟悉又稚嫩的声音。
“你好，我叫做工藤新一。”
“我叫毛利兰，请多关照！”
跨越时空般的，仅仅5岁的两个孩子，名为新一、兰。